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丁玮 高级工程师 电话：010-82649477 Email：dingwei@iphy.ac.cn |
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教育经历
2008/09 - 2011/01，中国科学院物理研究所，软物质物理重点实验室，博士，导师：江凡
2005/09 - 2008/07，西南大学，物理学院，硕士，导师：陈洪
2001/09 - 2005/07，西南师范大学，物理学院，学士
科研与学术工作经历
2017/03 - 至今，中国科学院物理研究所，软物质物理重点实验室，高级工程师
2013/08 - 2017/03，中国科学院生物物理研究所，蛋白质科学研究平台生物成像中心，高级工程师，高级技术主管
2011/02 - 2013/08，中国科学院生物物理研究所，生物大分子国家重点实验室，博士后，合作导师：刘志杰
工作简介：
2017/03 - 至今，主要从事X射线晶体学和电子显微学的方法学研究：
(1) 继承并发展基于直接法的结构解析流水线IPCAS2.0,以及基于参数空间筛选的结构解析流水线X2DF。
(2) 设计基于断层扫描电镜成像的多功能电控倾转台。
(3) 设计基于冷冻透射电镜的快速冷冻仪。
(4) 发展扫描电镜的图像收集和图像处理新方法。
(5) 发展冷冻电镜图像处理的新方法。
2013/08 - 2017/03, 主要负责冷冻电镜数据的处理和三维结构模型的构建。同时开展了与电镜相关的方法学研究，如：“背散射图像的Z轴分辨率提高算法的方法学研究”，“电镜数据收集、转移、处理和检测新方案的研究”。
2008/9 - 2013/08, 主要从事基于X-射线晶体学的生物大分子结构解析方法的研究工作。研发了新型的分子置换法程序PVMR以及基于实验相位法的结构解析云平台XCLOUD。
主持或参加科研项目（课题）及人才计划项目情况：
1.中国科学院仪器设备功能开发技术创新项目, 附着式透射电镜样品冷冻仪的设计,2019/08/13-2021/08/13，30万，在研，主持
2. 中国科学院物理研究所关键技术人才（高级工程师），2017年，物理科学
3.中国科学院仪器设备功能开发技术创新项目,提高扫描电子显微镜背散射电子成像Z轴分辨率的新方法,2015/09/15-2018/09/15，30万，在研，主持
4. 国家自然科学基金面上项目，31470037，基于剪切波变换的冷冻电镜电子断层数据的完全三维重构，2015/01/01 - 2016/12/01，30万，已结题，参与
5. 国家自然科学基金重点专项，31330019，胞质DNA感受因子识别病原体感染的分子机制研究，2014/01/01 - 2018/12/01，289万元，已结题、参与。
6. 国家自然科学基金面上项目，31270795、生物大分子晶体衍射数据收集和相位求解新技术和新方法研究，2013/01/01~2013/12/01，15万、已结题、参与。
代表性文章：
(1) Ding, W. *, Zhang, T., He, Y., Wang, J., Wu, L., Han, P., Zheng, C., Gu, Y., Zeng, L., Hao, Q*. & Fan, H. (2020). J. Appl. Cryst. 53, 253-261.
(2) Wei Ding$*,Xiao-Ting Wang$,Yang-Yang Yi. Development of “Parameter space screening”-based single-wavelength anomalous diffraction phasing and structure determination pipeline[J]. Chin. Phys. B, 2019, 28(11):116101.($: equal contribution)
(3) Pu Han,Yuan-Xin Gu,Wei Ding*, Hai-Fu Fan*. Enhancement of MAD/MIR phasing at low resolution and a new procedure for automatic phase extension[J]. Chin. Phys. B, 2019, 28(7):076108.
(4) Wenbo Li$ , Wei Ding$ , Gang Ji, Li Wang, Jianguo Zhang, Fei Sun(2016).Three-dimensional visualization of arsenic stimulated mouse liver sinusoidal by FIB-SEM approach.Protein & Cell7(24):1-6($: equal contribution)
(5) Ru, H.$, Zhao, L.$, Ding, W.$, Jiao, L., Shaw, N., Liang, W., Zhang, L., Hung, L., Matsugaki, N., Wakatsuki, S. and Liu, Z. J*, (2012) The S-SAD phasing study of DR6 and its solution conformation revealed by SAXS. Acta Cryst D68, 521-530 ($: equal contribution)
代表性会议报告
(1) 丁玮，直接法在冷冻电镜结构解析中的新应用，2019 年全国电子显微学学术年会，合肥，2019-10-15 ~ 2019-10-19
(2) Ding Wei, IPCAS: A Pipeline from Phasing to Model Building and Refinement for X-ray Diffraction Data and Cryo-EM Density Map, Asian Crystallographic Association Conference, Auckland, NZ, 4 Dec 2018
(3) Ding Wei, New features of IPCAS 1.2. CAS/CCP4 Workshop, Guangzhou, 23-27 Oct 2017
(4) Ding Wei, Crystal Cloud - HT Crystallography Tool Box, CAS Structural Immunology & Stem Cell Symposium, Kunming, 01 July 2012