中国科学院软物质物理实验室的总体定位是：以凝聚态物理和统计物理为基础，发展新方法、创造新技术，研究软物质的结构、响应和动力学；关注生命物质中被普遍关注但用传统方法难以解决的科学问题，获得标志性成果；为物理学与生命科学的交叉和学术交流提供优秀的研究平台，取得不可替代地位；形成软物质物理人才培养基地,为国家创新战略服务。
实验室的总体科学目标是：通过交叉联合、协力攻关，建立一个三维微尺度物理生物学研究综合平台，发展多种研究微观及介观层次生命物质结构和运动的独特物理方法与技术，取得原创性标志性研究成果，推动我国物理学与生命科学交叉研究领域的跨越发展。
实验室的主要研究和重点发展的方向是应用物理学先进的理论和实验手段在若干软物质和物理生物学前沿领域进行中长期布局，取得系列影响深远的科研成果，具体包括：超高时-空分辨蛋白质动态结构；分子与细胞的物理生物学；离散颗粒的集团响应与动力学；等离子物理的研究方向等。经过近二十年的发展，软物质物理重点实验室已经形成一个以分子和细胞的物理生物学的实验研究为鲜明特色，重点关注生物大分子的结构与动力学的综合研究团体。实验室在蛋白质结构解析的直接法研究方面处于国际领先地位；在单分子生物物理研究方面国内领先，在国际上也享有较高的声誉；在蛋白质超快动力学实验技术方面处于国内领先地位，取得的研究成果受到国际广泛关注。
验室目前有研究员 10名，副研究员 19名，实验技术人员 5名，在读研究生47名。实验室设行政秘书1名，负责实验室的日常管理和文秘工作。公共实验室设立副主任工程师2名，负责管理和开发公用实验室设备资源。实验室40岁以下的研究骨干14名，占总人数的百分之四十。年轻研究骨干在实验室的研究活动中扮演重要角色，很多重要的研究结果都与他们直接相关或由他们主导完成。实验室重视国际化学术建设，引进全职外籍人才2名。
组织机构
实验室主任： 叶方富 研究员 电话：010-82649779
实验室副主任： 陈科 研究员 电话：010-82649803
党支部书记： 叶方富 研究员 电话：010-82649779
分工会主席： 徐春华 副研究员 电话：010-82648122
公共技术组： 翟永亮 高级工程师 电话：010-82640224
公共技术组： 马璐 副主任工程师 电话：010-82640224
行政秘书： 范玮 电话：010-82649565 邮箱：sfmatter@iphy.ac.cn
